Στο Νομό Αιτωλοακαρνανίας υπάρχουν δύο Μητροπόλεις της Εκκλησίας της Ελλάδος:
Η Μητρόπολη Αιτωλίας και Ακαρνανίας, με έδρα το Μεσολόγγι και Μητροπολίτη τον κ. Κοσμά (Παπαχρήστο)
Η Μητρόπολη Ναυπάκτου και Αγίου Βλασίου, με έδρα τη Ναύπακτο και Μητροπολίτη τον κ. Ιερόθεο (Βλάχο)